これ、レンタカー会社の怠慢もあるので。

駐禁切られた時にちゃんと客に確認した後に、警察に話してるかもあるで。
警察から見ると、使用者不明のままなので、レンタカー会社しか分からない。レンタカー会社から使用者の情報を確証持って取るには捜査令状が必要。でもその手のコストを減らす為に反則金制度がある。

そもそも、期限内に弁明通知書返してないとか（なので納付命令が出てる）、相当レンタカー会社も怠慢なので、まあ、「使用者は違う」とか遅れて言われましてもねという。